国内刊号:11-2228/R
国际刊号:0529-1356
发布日期:
作者:孟盼,张熙,杨蕙,刘检,方锐,王枭冶,葛金文,刘彤彤,赵洪庆,王宇红
单位:1.湖南中医药大学中西医结合学院,长沙 410208; 2.湖南省脑科医院科研部,长沙 410007;3.湖南中医药大学第一附属医院医学实验中心,长沙 410007; 4.湖南省中医药研究院,长沙 410006; 5.湖南中医药大学科技创新中心,长沙 410208
关键词:微小RNA, 长链非编码RNA, 环状RNA, 抑郁症, 神经可塑性, 全转录组技术, 大鼠
基金:湖南省自然科学基金优秀青年项目;湖南省科技创新人才计划优秀博士后创新人才项目;长沙市杰出创新青年培养计划
目的: 筛选慢性应激抑郁模型大鼠海马组织中微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)的表达谱及其竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨抑郁症潜在的病理生理机制。:: 方法: 12只SD 大鼠分为空白组和模型组,采用慢性温和不可预测性应激(CUMS)构建抑郁症大鼠模型,取大鼠海马组织进行全转录组分析,并用生物信息学方法找出可能存在的 lncRNA-miRNA-mRNA、circRNA-miRNA-mRNA调控网络。:: 结果: 根据|差异倍数(fold change)|≥1.5和P≤0.05共鉴定出29个差异miRNAs(上调21个,下调8个),686个差异lncRNAs(上调163个,下调523个),8个差异circRNAs(上调3个,下调5个)。基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,miRNAs的靶基因主要富集于细胞膜内的高尔基体和钙离子结合过程;LncRNAs靶基因的功能涉及核酸结合的调节、细胞因子和蛋白质泛素化等;CircRNAs的宿主基因主要集中在细胞刺激反应、代谢进程、催化活性等过程中。LncRNAs和circRNAs相互竞争的ceRNA网络显示,非编码RNA(ncRNA)与突触可塑性相关的mRNA之间存在复杂相互作用,如与轴突导向相关的Wnt-ta蛋白(WNT5a)和Ⅷ型胶原α1(COL8α1),以及神经发育相关的层黏连蛋白A2(LAMA2)。:: 结论: LncRNA和circRNA的ceRNA网络显示,ncRNA和mRNA之间的复杂相互作用与抑郁症的神经可塑性受损有关。
来源:2023年第4期
《解剖学报》期刊编辑部