国内刊号:11-2228/R
国际刊号:0529-1356
发布日期:
作者:李晓军,张雅敏
单位:1.天津医科大学第一中心临床学院,天津 300070; 2.天津市第一中心医院肝胆外科,天津 300192
关键词:铁死亡, 结肠细胞癌, 预后模型, 生物信息学, Cox回归分析, 人
基金:天津市科技计划项目
目的: 探讨结肠癌(CC)中具有预后意义的铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNAs),并构建预后相关的预测评分模型,最后得到与预后相关lncRNAs共表达的铁死亡相关差异基因。:: 方法: 从FerrDb数据库下载铁死亡相关基因(FGs),在TCGA数据库中共下载41例癌旁正常组织、473例肿瘤组织的表达数据和452位患者的临床数据,通过共表达和差异分析确定铁死亡相关的差异lncRNA(DEFlncRNAs),使用单因素Cox回归分析确定预后相关的DEFlncRNAs,再运用多因素Cox回归分析构建预后模型、计算患者的风险得分,根据风险得分的中位数将患者分为高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier风险曲线、单因素和多因素Cox回归分析和受试者工作特征(ROC)曲线验证模型的准确性,而后绘制列线图预测患者生存情况。最终,通过共表达分析找到调控DEFlncRNAs的铁死亡差异基因,并用免疫组织化学实验验证表达差异。:: 结果: 从TCGA数据库下载CC样本的表达及临床数据,并成功构建了含28个lncRNAs的风险预后模型,模型可较好地预测结肠癌患者的预后;成功构建了可预测患者总体生存期的列线图,该模型具有良好的临床应用价值。最后通过DEFlncRNAs和差异表达的铁死亡相关基因(DEFGs)共表达分析,得到相关系数过滤标准(|corFilter|)>0.4,P 值过滤标准(P value filter)<0.05的共表达网络,包含17个关键DEFGs。免疫组织化学实验验证ANGPTL7在CC患者癌旁组织中高表达。:: 结论: 成功构建了含28个DEFlncRNAs的结肠癌预后模型,最后得到17个关键DEFGs。
来源:2023年第4期
《解剖学报》期刊编辑部