解剖学报

作者：谭玉靓,戴姿薇,唐标

单位：1. 湖南中医药大学医学院2016级; 2. 湖南中医药大学医学院生理学教研室， 长沙 410208；

关键词：肝细胞癌, 生物信息学, 泛素D, 磷脂酰肌醇蛋白聚糖3, GEPIA数据库, 人

基金：湖南省教育厅科学研究项目优秀青年项目

目的： 利用基因组学和表观遗传组学分析工具，分析磷脂酰肌醇蛋白聚糖3（GPC3）和泛素D（UBD）在肝细胞癌（HCC）中的异常表达情况，以及两者对HCC患者预后的影响。 ： 方法： 利用ULCAN（http://ualan.path.uab.edu）和Gene Expression Profiling Interative Analysis(GEPIA)数据库，分析UBD和GPC3在正常肝组织和HCC组织的异常表达情况和甲基化水平，以及对HCC患者生存的影响。利用GeneCards数据库分析UBD和GPC3的定位。利用STRING数据库对UBD和GPC3分别构建蛋白质互相作用（PPI）网络，并对UBD和GPC3进行基因注释。基于皮尔森相关系数，计算UBD和GPC3在HCC发生发展中的关联。 ： 结果： UBD和GPC3在HCC组织中表达上调，启动子甲基化水平下降。UBD位于6p22.1，主要表达于细胞核；GPC3位于Xq26.2，主要表达于细胞膜、细胞外基质、内质网、溶酶体和高尔基体。富集分析显示，UBD主要与蛋白酶体活动相关：翻译后蛋白修饰、泛素化和去泛素化；GPC3主要参与黏多糖的生物合成和分解过程，介导的生物通路主要涉及癌症多聚糖、细胞外基质受体相互作用和细胞黏附分子。关联分析显示，UBD和GPC3成线性正相关，共同调控HCC的发生发展。预后分析显示，GPC3对HCC的预后有明显的影响。 ： 结论： UBD和GPC3在HCC的表达均上调，甲基化水平均降低，GPC3对HCC的预后影响较大，或许可以作为预后评估的生物标志。

来源：2021年第5期

《解剖学报》期刊编辑部

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