国内刊号:11-2228/R
国际刊号:0529-1356
发布日期:
作者:王棋文,姚奋杰,杨卓菲,郭学强,穆萌萌,周运,徐存拴
单位:1.河南师范大学生命科学学院,河南省科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地,河南 新乡 453007; 2.河南师范大学生命科学学院,河南省肺纤维化生物学国际联合实验室,河南 新乡 453007; 3.河南师范大学计算机与信息工程学院,河南 新乡 453007
关键词:自噬, 肝再生, 高通量测序, 大鼠
目的: 探讨大鼠肝再生中环状RNA(circRNA)的表达变化以及对自噬的影响。:: 方法: 以60只大鼠 2/3 肝切除0 h、 2 h、6 h、12 h、24 h、30 h、36 h、72 h、120 h和168 h后的再生肝circRNAs、微小RNAs(miRNAs)、mRNA的高通量测序数据为基础,分析其在肝再生中的表达变化,进一步用miRanda aug 2010软件预测circRNA-miRNA和miRNA-mRNA靶标关系,并根据基因功能→miRNA功能→circRNA功能反向推测得到支配大鼠肝脏自噬的肝再生相关circRNAs和miRNAs,并构建它们的相互作用网络。:: 结果: 与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs、mRNA分别有102、42、153种。利用生物信息学分析,发现44种circRNAs、13种miRNAs及17种mRNA之间有相互作用关系,并以此构建了它们的共表达网络。:: 结论: 筛选出了与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs和mRNA,并构建了相互作用网络图谱。
来源:2021年第4期
《解剖学报》期刊编辑部