国内刊号:11-2228/R
国际刊号:0529-1356
发布日期:
作者:刘发煇,侯婉云,梁家东,徐晶晶,罗春英
单位:1.右江民族医学院附属医院病理科,广西 百色 533000; 2.右江民族医学院附属医院病理诊断与研究中心,广西 百色 533000
关键词:唾液腺腺样囊性癌, 微小RNA, 生物信息学
基金:2015年度广西高校重点实验室开放课题;广西医疗卫生适宜技术开发与推广应用项目;百色市科技计划课题
目的: 探讨唾液腺腺样囊性癌(SACC)潜在的微小RNAs(miRNAs)分子标志物,构建miRNA-mRNA调控网络,并阐明其潜在的分子机制。:: 方法: 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载2个SACC的微阵列芯片数据,通过R语言进行分析差异的miRNAs与mRNA。应用FunRich 3.1.3软件对差异miRNA进行转录因子富集分析以及预测差异miRNAs的靶基因。对SACC中差异miRNAs的靶基因进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以及蛋白互作分析。使用Cytoscape 3.7.0构建miRNA-mRNA调控网络。:: 结果: 1. 共筛选出144个差异表达的miRNAs (DEMs)和1216个差异表达的mRNAs(DEGs);2. KEGG信号通路富集分析发现,靶基因主要参与Rap1信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路以及肌动蛋白细胞骨架的调节;3. STRING蛋白相互作用分析发现,ACSL1、SCD、MGLL、FABP4在蛋白相互作用网络中处于核心地位。:: 结论: 我们筛选出SACC与相对正常组织间差异明显的miRNA和mRNA,并分析发现了这些差异分子主要参与的信号通路和功能。
来源:2021年第4期
《解剖学报》期刊编辑部