解剖学报

作者：李凤娇,咸伟伟,卜硕蕾,曹静丽,吴劲松,李文生,尤琳雅

单位：1.复旦大学基础医学院人体解剖学与组织学胚胎学系，上海 200032; 2.复旦大学生物医学研究院，上海 200032; 3.复旦大学附属华山医院神经外科，上海 200040; 4. 上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室，上海 200032；

关键词：脑脊液酸碱度, 脑组织, 核糖核酸, 蛋白质, HE染色, 人

目的 通过对脑脊液pH值、脑组织RNA完整值（RIN）、转录组和蛋白质组检测以及形态学观察，评估上海脑库收集的脑组织用于后续生物学研究的可行性。：：方法 使用pH试纸检测新鲜脑脊液pH值；使用安捷伦RNA 6000 Nano芯片和2100生物分析仪对低温冻存的脑组织RNA进行完整性检测；使用BGIseq-500测序仪对低温冻存的颞上回（STG）或尾状核（CN）进行转录组测序；使用Q Exactive HF质谱仪对低温冻存脑组织进行蛋白质组分析；使用HE染色观察STG的形态学。：结果 捐献脑组织样本的脑脊液pH值在6.5左右；65%以上的低温冻存脑组织的RIN>6，RNA质量较好；转录组测序过滤后clean reads比值>20或30的碱基数占总碱基数比例基本达到80%以上，表明文库质量较高；质谱分析得到超过4000个蛋白质组，3万多个肽段，说明蛋白数据质量较好；脑组织形态学较为正常，能清晰观察到神经元形态。：：结论 上海脑库脑组织样本的RNA和蛋白质质量能用于开展分子生物学相关研究，并可用于形态学观察。：

来源：2021年第2期

《解剖学报》期刊编辑部

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