国内刊号:11-2228/R
国际刊号:0529-1356
发布日期:
作者:郭学强,郭建林,靳伟,常翠芳,徐存拴,陈广文
单位:1.河南师范大学生命科学学院; 2.细胞分化调控国家重点实验室培育基地,河南 新乡 453007;
关键词:肝再生, 细胞增殖, 竞争性内源RNA网络, 环状RNA, 生物高通量检测, 大鼠
基金:4种共表达microRNA协同调节大鼠肝细胞增殖和肝再生的分子机制研究;秦岭山脉淡水三肠目涡虫分类和区系研究;海南岛淡水三肠目涡虫生态学及进化生物学研究;组织再生关键基因的筛选及功能研究—以日本三角涡虫为例
目的 探讨环状RNA(circRNA)在大鼠肝再生中的表达变化及其对细胞增殖的调节作用。:: 方法 用生物高通量检测方法分析114只2/3肝切除大鼠诱导的大鼠肝再生中circRNA的表达变化,用miRanda和TargetScan网站分析大鼠肝再生的靶微小RNA(miRNA)及其mRNA,用基因本体论(GO)和IPA软件分析大鼠肝再生涉及的生理活动和信号通路,用Cytoscape v3.0.2软件构建大鼠肝再生的相互作用网络,用表达模式结合靶miRNA数量和功能挑选候选关键circRNA。:: 结果 在大鼠再生肝材料中检测到20 878个circRNA,其中,560个发生差异表达,它们中的126个能与117个靶miRNA结合,后者调节6510个下游靶mRNA。这些靶mRNA涉及细胞增殖、应激反应、物质代谢等生理活动和转化生长因子β(TGF-β)、蛋白激酶A(PKA)、Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)等信号通路。其中,circRNA_03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA可能通过12种miRNA调节15种mRNA进而在大鼠肝再生涉及的细胞增殖中发挥作用,视为大鼠肝再生的候选关键circRNA。:: 结论 大鼠肝再生中560个circRNA发生差异表达,其中circRNA_03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA通过12种miRNA和15种mRNA的相互作用网络支配大鼠肝再生涉及的细胞增殖。
来源:2021年第2期
《解剖学报》期刊编辑部